Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND1P24385 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND1P24385 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND1P24385 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND1P24385 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND1P24385 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND1P24385 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND1P24385 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCND1P24385 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND1P24385 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND1P24385 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND1P24385 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND1P24385 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND1P24385 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCND1P24385 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND1P24385 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND1P24385 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND1P24385 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND1P24385 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND1P24385 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND1P24385 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND1P24385 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND1P24385 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCND1P24385 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCND1P24385 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCND1P24385 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCND1P24385 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCND1P24385 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCND1P24385 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND1P24385 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND1P24385 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND1P24385 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND1P24385 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND1P24385 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCND1P24385 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCND1P24385 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCND1P24385 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCND1P24385 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCND1P24385 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCND1P24385 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCND1P24385 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCND1P24385 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCND1P24385 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCND1P24385 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCND1P24385 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND1P24385 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND1P24385 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND1P24385 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND1P24385 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND1P24385 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND1P24385 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND1P24385 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND1P24385 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND1P24385 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND1P24385 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND1P24385 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND1P24385 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND1P24385 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND1P24385 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND1P24385 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND1P24385 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND1P24385 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND1P24385 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms