Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNI1P19237 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI1P19237 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms