Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A3P13637 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A3P13637 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms