Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNAP12004 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNAP12004 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNAP12004 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCNAP12004 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNAP12004 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNAP12004 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNAP12004 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNAP12004 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNAP12004 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNAP12004 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNAP12004 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNAP12004 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNAP12004 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNAP12004 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNAP12004 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNAP12004 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNAP12004 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNAP12004 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNAP12004 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCNAP12004 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCNAP12004 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNAP12004 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNAP12004 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNAP12004 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNAP12004 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNAP12004 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNAP12004 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCNAP12004 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNAP12004 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNAP12004 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNAP12004 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCNAP12004 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCNAP12004 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCNAP12004 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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