Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LETM1O95202 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LETM1O95202 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LETM1O95202 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LETM1O95202 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LETM1O95202 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LETM1O95202 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LETM1O95202 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LETM1O95202 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LETM1O95202 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LETM1O95202 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LETM1O95202 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LETM1O95202 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LETM1O95202 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LETM1O95202 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LETM1O95202 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LETM1O95202 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LETM1O95202 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LETM1O95202 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LETM1O95202 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LETM1O95202 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LETM1O95202 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LETM1O95202 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LETM1O95202 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LETM1O95202 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LETM1O95202 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LETM1O95202 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LETM1O95202 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LETM1O95202 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LETM1O95202 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LETM1O95202 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LETM1O95202 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LETM1O95202 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LETM1O95202 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LETM1O95202 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LETM1O95202 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LETM1O95202 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LETM1O95202 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LETM1O95202 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LETM1O95202 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LETM1O95202 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LETM1O95202 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LETM1O95202 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LETM1O95202 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LETM1O95202 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LETM1O95202 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LETM1O95202 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LETM1O95202 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LETM1O95202 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LETM1O95202 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LETM1O95202 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LETM1O95202 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LETM1O95202 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LETM1O95202 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LETM1O95202 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LETM1O95202 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LETM1O95202 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LETM1O95202 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LETM1O95202 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LETM1O95202 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LETM1O95202 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LETM1O95202 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LETM1O95202 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LETM1O95202 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LETM1O95202 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LETM1O95202 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LETM1O95202 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LETM1O95202 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LETM1O95202 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LETM1O95202 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LETM1O95202 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LETM1O95202 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LETM1O95202 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LETM1O95202 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LETM1O95202 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms