Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP2O95045 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP2O95045 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP2O95045 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP2O95045 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP2O95045 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP2O95045 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP2O95045 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPP2O95045 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPP2O95045 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP2O95045 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP2O95045 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP2O95045 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP2O95045 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP2O95045 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP2O95045 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP2O95045 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPP2O95045 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP2O95045 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP2O95045 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP2O95045 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP2O95045 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP2O95045 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP2O95045 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP2O95045 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP2O95045 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPP2O95045 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP2O95045 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP2O95045 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP2O95045 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP2O95045 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP2O95045 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP2O95045 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP2O95045 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UPP2O95045 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UPP2O95045 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UPP2O95045 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UPP2O95045 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
UPP2O95045 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP2O95045 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP2O95045 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPP2O95045 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPP2O95045 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms