Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN5O94779 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN5O94779 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms