Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRAK2O60296 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAK2O60296 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAK2O60296 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms