Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYO1BO43795 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1BO43795 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1BO43795 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms