Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN3O15551 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN3O15551 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms