Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEIS3P2A8K0S8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS3P2A8K0S8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms