Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms