Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms