Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PTPRJQ12913 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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PTPRJQ12913 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PTPRJQ12913 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PTPRJQ12913 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PTPRJQ12913 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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