Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms