Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DENRO43583 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DENRO43583 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DENRO43583 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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