Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms