Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms