Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms