Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms