Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XBP1P17861 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XBP1P17861 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms