Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYH1P12882 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYH1P12882 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYH1P12882 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MYH1P12882 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MYH1P12882 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYH1P12882 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYH1P12882 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYH1P12882 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYH1P12882 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYH1P12882 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYH1P12882 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYH1P12882 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYH1P12882 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYH1P12882 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms