Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ACSL4O60488 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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ACSL4O60488 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ACSL4O60488 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ACSL4O60488 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ACSL4O60488 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ACSL4O60488 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ACSL4O60488 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACSL4O60488 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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