Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT74Q96LB3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms