Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA4

MS4A14, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 14, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A14Q96JA4 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MS4A14Q96JA4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms