Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYRIPQ8NFW9 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms