Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms