Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms