Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SBK1Q52WX2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SBK1Q52WX2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms