Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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