Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms