Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms