Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ACTBP60709 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ACTBP60709 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ACTBP60709 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ACTBP60709 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ACTBP60709 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ACTBP60709 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ACTBP60709 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ACTBP60709 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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ACTBP60709 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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ACTBP60709 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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ACTBP60709 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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