Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms