Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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