Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms