Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX1P83916 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX1P83916 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms