Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XBP1P17861 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XBP1P17861 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XBP1P17861 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms