Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKAB2O43741 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms