Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms