Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTOP1Q7RTM1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms