Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
GABRA6Q16445 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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