Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms