Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms