Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP5P45974 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP5P45974 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP5P45974 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP5P45974 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP5P45974 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP5P45974 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms