Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TFPTP0C1Z6 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TFPTP0C1Z6 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TFPTP0C1Z6 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TFPTP0C1Z6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TFPTP0C1Z6 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TFPTP0C1Z6 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TFPTP0C1Z6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TFPTP0C1Z6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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