Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F8W031 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F8W031 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F8W031 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8W031 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8W031 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F8W031 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms