Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABARAPL3Q9BY60 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABARAPL3Q9BY60 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GABARAPL3Q9BY60 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms