Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms