Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms